关于您的问题，以下是我的解答：
### 一、对方小规模纳税人卖给我公司有机肥开的是免税的发票，那么我公司在销售这批有机肥的话开的发票也是免税的发票吗？
根据税法规定，一般纳税人从小规模纳税人处采购的货物或服务，如果对方开具的是免税发票，则该笔交易的进项税额为零。因此，当您的公司作为一般纳税人销售这批有机肥时，由于没有进项税额可以抵扣，您需要按照适用税率计算销项税额并缴纳增值税。
### 二、如果说对方小规模公司放弃了免税政策给我公司开的是1%或者是3%专用的发票的话，那么我公司在销售这批有机肥的话对外开的税率是多少呢？
1. 进项税额：如果对方小规模纳税人放弃免税政策给您公司开具了1%或3%的专用发票，那么您可以按照发票上的税率抵扣相应的进项税额。
2. 销项税额：对于您公司销售有机肥的税率，需要根据您公司的具体情况来确定。如果您公司是一般纳税人，并且有机肥属于您公司的主营业务之一，那么您应该按照适用的增值税税率（例如9%）来计算销项税额。但是，请注意，具体的税率可能会因地区和行业而有所不同，建议咨询当地税务机关以获取最新信息。
3. 计算方式：增值税应纳税额 = 销项税额 - 进项税额。其中，销项税额 = 销售额 × 适用税率；进项税额 = 购进货物或服务的金额 × 适用税率。
综上所述，如果您公司是一般纳税人，并且从小规模纳税人处采购了有机肥并取得了专用发票，那么您可以按照发票上的税率抵扣进项税额，并在销售时按照适用的增值税税率计算销项税额。具体的税率和计算方式可能因地区和行业而有所不同，请务必咨询当地税务机关以获取准确信息。
关于您的问题，以下是我的解答：
一、对方小规模纳税人卖给我公司有机肥开的是免税的发票，那么我公司在销售这批有机肥的话开的发票也是免税的发票吗？
根据税法规定，一般纳税人从小规模纳税人处采购的货物或服务，如果对方开具的是免税发票，则该笔交易的进项税额为零。因此，当您的公司作为一般纳税人销售这批有机肥时，由于没有进项税额可以抵扣，您需要按照适用税率计算销项税额并缴纳增值税。
二、如果说对方小规模公司放弃了免税政策给我公司开的是1%或者是3%专用的发票的话，那么我公司在销售这批有机肥的话对外开的税率是多少呢？
1. 进项税额：如果对方小规模纳税人放弃免税政策给您公司开具了1%或3%的专用发票，那么您可以按照发票上的税率抵扣相应的进项税额。
2. 销项税额：对于您公司销售有机肥的税率，需要根据您公司的具体情况来确定。如果您公司是一般纳税人，并且有机肥属于您公司的主营业务之一，那么您应该按照适用的增值税税率（例如9%）来计算销项税额。但是，请注意，具体的税率可能会因地区和行业而有所不同，建议咨询当地税务机关以获取最新信息。
3. 计算方式：增值税应纳税额 = 销项税额 - 进项税额。其中，销项税额 = 销售额 × 适用税率；进项税额 = 购进货物或服务的金额 × 适用税率。
综上所述，如果您公司是一般纳税人，并且从小规模纳税人处采购了有机肥并取得了专用发票，那么您可以按照发票上的税率抵扣进项税额，并在销售时按照适用的增值税税率计算销项税额。具体的税率和计算方式可能因地区和行业而有所不同，请务必咨询当地税务机关以获取准确信息。
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