总分支机构所得税的分摊申报，季度预缴和汇算清缴时都需要进行分摊申报，且总公司和分公司都参与申报，以下为你详细介绍：
季度预缴申报
分摊依据：依据《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》（国家税务总局公告 2012 年第 57 号），居民企业在中国境内跨地区（指跨省、自治区、直辖市和计划单列市 ）设立不具有法人资格分支机构的，该居民企业为跨地区经营汇总纳税企业（另有规定除外），实行 “统一计算、分级管理、就地预缴、汇总清算、财政调库” 的企业所得税征收管理办法 。
分摊计算：总机构应按照上年度分支机构的营业收入、职工薪酬和资产总额三个因素计算各分支机构分摊所得税款的比例，三因素的权重依次为 0.35、0.35、0.30 。
计算公式为：某分支机构分摊比例 =（该分支机构营业收入／各分支机构营业收入之和）×0.35+（该分支机构职工薪酬／各分支机构职工薪酬之和）×0.35+（该分支机构资产总额／各分支机构资产总额之和）×0.30 。
总机构根据汇总计算的企业当期应纳所得税额的 25%，在每月或季度终了后 15 日内自行向所在地主管税务机关申报预缴；另外 25% 由总机构就地办理缴库或退库；剩余 50% 在各分支机构间分摊，各分支机构根据分摊税款就地办理缴库或退库。
申报流程：总机构在电子税务局或前往办税服务厅进行企业所得税预缴申报时，填写《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A 类）》 ，并同时报送《跨地区经营汇总纳税企业所得税分配表》。各分支机构在季度终了之日起 15 日内，根据总机构出具的《企业所得税汇总纳税分支机构所得税分配表》，向其所在地主管税务机关申报预缴企业所得税。
汇算清缴申报
分摊原则：总机构应自年度终了之日起 5 个月内，计算汇总纳税企业的年度应纳税所得额、应纳所得税额，抵减总机构、分支机构当年已就地分期预缴的企业所得税款后，多退少补 。
申报流程：总机构进行汇算清缴申报，填写《中华人民共和国企业所得税年度纳税申报表（A 类）》 ，并报送《跨地区经营汇总纳税企业年度分摊企业所得税明细表》等相关资料。各分支机构应在总机构汇算清缴后，根据总机构出具的《企业所得税汇总纳税分支机构所得税分配表》，向其所在地主管税务机关办理年度纳税申报，只需要填报《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A 类）》，无需报送年度纳税申报表。
总分支机构所得税的分摊申报，季度预缴和汇算清缴时都需要进行分摊申报，且总公司和分公司都参与申报，以下为你详细介绍：
季度预缴申报
分摊依据：依据《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》（国家税务总局公告 2012 年第 57 号），居民企业在中国境内跨地区（指跨省、自治区、直辖市和计划单列市 ）设立不具有法人资格分支机构的，该居民企业为跨地区经营汇总纳税企业（另有规定除外），实行 “统一计算、分级管理、就地预缴、汇总清算、财政调库” 的企业所得税征收管理办法 。
分摊计算：总机构应按照上年度分支机构的营业收入、职工薪酬和资产总额三个因素计算各分支机构分摊所得税款的比例，三因素的权重依次为 0.35、0.35、0.30 。
计算公式为：某分支机构分摊比例 =（该分支机构营业收入／各分支机构营业收入之和）×0.35+（该分支机构职工薪酬／各分支机构职工薪酬之和）×0.35+（该分支机构资产总额／各分支机构资产总额之和）×0.30 。
总机构根据汇总计算的企业当期应纳所得税额的 25%，在每月或季度终了后 15 日内自行向所在地主管税务机关申报预缴；另外 25% 由总机构就地办理缴库或退库；剩余 50% 在各分支机构间分摊，各分支机构根据分摊税款就地办理缴库或退库。
申报流程：总机构在电子税务局或前往办税服务厅进行企业所得税预缴申报时，填写《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A 类）》 ，并同时报送《跨地区经营汇总纳税企业所得税分配表》。各分支机构在季度终了之日起 15 日内，根据总机构出具的《企业所得税汇总纳税分支机构所得税分配表》，向其所在地主管税务机关申报预缴企业所得税。
汇算清缴申报
分摊原则：总机构应自年度终了之日起 5 个月内，计算汇总纳税企业的年度应纳税所得额、应纳所得税额，抵减总机构、分支机构当年已就地分期预缴的企业所得税款后，多退少补 。
申报流程：总机构进行汇算清缴申报，填写《中华人民共和国企业所得税年度纳税申报表（A 类）》 ，并报送《跨地区经营汇总纳税企业年度分摊企业所得税明细表》等相关资料。各分支机构应在总机构汇算清缴后，根据总机构出具的《企业所得税汇总纳税分支机构所得税分配表》，向其所在地主管税务机关办理年度纳税申报，只需要填报《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A 类）》，无需报送年度纳税申报表。
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