船舶退税的退税发票怎么处理?

按照《国家税务总局关于增值税发票综合服务平台等事项的公告》(国家税务总局公告2020 年第1 号)的规定，船舶退税的退税发票应该如下处理：

1.退税发票的处理。

运输企业取得的增值税专用发票用于办理船舶退税时，纳税人取得增值税专用发票后，如需用于申报抵扣增值税进项税额或申请出口退税、代办退税，应当登录增值税发票综合服务平台确认发票用途。纳税人已经确认用途为申请出口退税或代办退税的发票，如改用于申报抵扣，应当向主管税务机关提出申请，经主管税务机关核实该发票尚未申报出口退税，并将发票电子信息回退后，由纳税人调整用途。即运输企业在取得发票后要在增值税发票综合管理服务平台做“退税勾选”。如果企业已做“退税勾选”，但需改为抵扣的，可填写《增值税专用发票误勾选退税且未申报退税回退数据》申请表，经主管税务机关审核通过后，在增值税发票综合服务平台重新进行抵扣勾选。如果已进行“退税勾选”办理退税，后发生补缴退税的，应在补缴退税后，通过“互联网+ 便捷退税”系统申请开具《出口货物转内销证明》。经主管税务机关审核通过后，在增值税发票综合服务平台中的“抵扣勾选——出口转内销发票勾选”模块进行抵扣勾选。

2. 退税备案的处理。

运输企业因退税备案资料或填写内容不符合要求的，主管税务机关应一次性告知运输企业，待其补正后再予以备案。

3.“非接触式”退税的处理。

根据《国家税务总局关于做好新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间出口退(免)税有关工作的通知》(税总函〔2020〕28 号)规定，在疫情防控期间，运输企业可通过“非接触式”方式申报办理出口退(免)税备案和申报退税事项。运输企业办理上述涉税事项时应提交的纸质资料，已实现纸质资料影像化申报的地区，可按现行方式提交;未实现纸质资料影像化申报的地区，暂不要求纳税人提交，疫情防控结束后再行补报。

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