根据您的描述，老板的工资不再通过公司发放，但社保仍在公司名下。在这种情况下，个税申报时仍需要保留老板的社保部分。关于您提到的工资表中个人社保部分的处理，以及这是否会影响期末单位社保部分的值和汇算清缴的单位社保部分的值，以下是我的专业解答：
1. **工资表处理**：即使老板的工资不再通过公司发放，但在计算个税时，仍需考虑其社保部分。因此，在工资表中应体现老板的个人社保部分，即使这部分是负数。
2. **社保影响分析**：由于老板的社保仍在公司名下，这不会直接影响到期末单位社保部分的值。因为社保的缴纳是基于员工的实际收入进行的，而老板的收入为零，所以其个人社保部分不会影响整体数值。
3. **汇算清缴影响**：在汇算清缴时，单位社保部分的值主要取决于全体员工的社保缴纳情况。由于老板的收入为零，其个人社保部分不会对汇算清缴产生影响。
4. **税务合规性**：根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》规定，工资薪金所得以实际发放工资时取得的收入为基础计算应纳税所得额。因此，即使工资未发，也应按照实际发放的工资薪金进行税款的计算，并在规定的申报期内进行税款申报。
综上所述，老板的个人社保部分应在工资表中体现，即使为负数也不会影响期末单位社保部分的值和汇算清缴的单位社保部分的值。同时，确保税务申报的合规性是非常重要的。
根据您的描述，老板的工资不再通过公司发放，但社保仍在公司名下。在这种情况下，个税申报时仍需要保留老板的社保部分。关于您提到的工资表中个人社保部分的处理，以及这是否会影响期末单位社保部分的值和汇算清缴的单位社保部分的值，以下是我的专业解答：
1. 工资表处理：即使老板的工资不再通过公司发放，但在计算个税时，仍需考虑其社保部分。因此，在工资表中应体现老板的个人社保部分，即使这部分是负数。
2. 社保影响分析：由于老板的社保仍在公司名下，这不会直接影响到期末单位社保部分的值。因为社保的缴纳是基于员工的实际收入进行的，而老板的收入为零，所以其个人社保部分不会影响整体数值。
3. 汇算清缴影响：在汇算清缴时，单位社保部分的值主要取决于全体员工的社保缴纳情况。由于老板的收入为零，其个人社保部分不会对汇算清缴产生影响。
4. 税务合规性：根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》规定，工资薪金所得以实际发放工资时取得的收入为基础计算应纳税所得额。因此，即使工资未发，也应按照实际发放的工资薪金进行税款的计算，并在规定的申报期内进行税款申报。
综上所述，老板的个人社保部分应在工资表中体现，即使为负数也不会影响期末单位社保部分的值和汇算清缴的单位社保部分的值。同时，确保税务申报的合规性是非常重要的。
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