出现这种情况，一般有以下几种原因：
1. 收入确认原则差异：
- 会计与税务处理不同：会计上，营业收入的确认遵循《企业会计准则》，通常在商品所有权上的主要风险和报酬转移给购货方、企业既没有保留通常与所有权相联系的继续管理权也没有对已售出的商品实施有效控制、收入的金额能够可靠地计量等条件下确认。而增值税纳税义务发生时间依据《增值税暂行条例》及其实施细则，有明确的销售货物、提供应税劳务等不同情形下的具体规定，两者存在差异会导致汇算清缴时营业收入与本属期增值税收入不一致。例如，采取预收货款方式销售货物，增值税纳税义务发生时间为货物发出的当天（除生产销售生产工期超过12个月的大型机械设备等特殊规定外），但会计上可能在收到预收账款时先确认为负债，待符合收入确认条件时才确认营业收入，这就可能造成某一期间增值税收入和营业收入的差异。
- 特殊业务处理差异：对于一些特殊业务，如视同销售行为，会计上可能不确认收入或仅按成本结转，但增值税需要按照公允价值计算销售额并缴纳增值税。例如，企业将自产产品用于职工福利，会计上按成本计入费用，不确认收入，但增值税需视同销售，按照市场价格计算增值税销项税额，从而导致增值税收入大于营业收入。
2. 申报数据错误：
- 填写错误：在填写增值税申报表或企业所得税汇算清缴申报表时，可能出现数据录入错误、错行、错列等情况，导致两者数据不一致。比如将增值税申报表中的某笔收入金额填错位置，或者在汇算清缴时误将不属于本期的收入计入等。
- 数据统计口径不一致：企业在统计增值税收入和营业收入时，可能采用了不同的统计口径。例如，增值税申报中可能包含了一些免税收入、不征税收入等，而在计算营业收入时没有正确扣除这些项目，或者在统计营业收入时遗漏了某些应计入的项目，如其他业务收入等，都会造成两者之间的差异。
3. 时间性差异：
- 收入所属期间不同：如果企业存在提前或延后确认收入的情况，可能会导致增值税收入和营业收入在不同期间出现差异。例如，企业在12月底发出货物，但未及时开具发票，按照增值税规定，发货当天即产生增值税纳税义务，需在当期申报增值税收入；但会计上可能在次年1月才确认该笔收入，这就会造成当年汇算清缴时营业收入与本属期增值税收入不一致。
- 发票开具与记账时间差异：企业开具发票的时间与记账确认收入的时间可能不同步。如企业先开具发票，但尚未发货或提供服务，按照增值税规定需确认增值税收入，但会计上因不符合收入确认条件而未确认营业收入；或者企业先发货或提供服务并确认了营业收入，但未及时开具发票，导致增值税收入滞后于营业收入确认。
4. 税收政策调整与会计处理变更：
- 税收政策变化：如果在一个纳税年度内，国家出台了新的税收政策，对增值税的征收范围、税率、纳税义务发生时间等进行调整，而企业未能及时准确地按照新政策进行申报，就可能导致汇算清缴时增值税收入与营业收入出现差异。例如，某项业务原来不征收增值税，后来政策调整后需要缴纳增值税，但企业在会计处理上未及时调整，仍按原方式确认营业收入，就会出现差异。
- 会计政策变更：企业自身进行会计政策变更，如改变收入确认的方法、会计估计等，也可能引起会计上营业收入的变化，而增值税收入可能不会随之同步变动，从而产生差异。
出现这种情况，一般有以下几种原因：
1. 收入确认原则差异：
- 会计与税务处理不同：会计上，营业收入的确认遵循《企业会计准则》，通常在商品所有权上的主要风险和报酬转移给购货方、企业既没有保留通常与所有权相联系的继续管理权也没有对已售出的商品实施有效控制、收入的金额能够可靠地计量等条件下确认。而增值税纳税义务发生时间依据《增值税暂行条例》及其实施细则，有明确的销售货物、提供应税劳务等不同情形下的具体规定，两者存在差异会导致汇算清缴时营业收入与本属期增值税收入不一致。例如，采取预收货款方式销售货物，增值税纳税义务发生时间为货物发出的当天（除生产销售生产工期超过12个月的大型机械设备等特殊规定外），但会计上可能在收到预收账款时先确认为负债，待符合收入确认条件时才确认营业收入，这就可能造成某一期间增值税收入和营业收入的差异。
- 特殊业务处理差异：对于一些特殊业务，如视同销售行为，会计上可能不确认收入或仅按成本结转，但增值税需要按照公允价值计算销售额并缴纳增值税。例如，企业将自产产品用于职工福利，会计上按成本计入费用，不确认收入，但增值税需视同销售，按照市场价格计算增值税销项税额，从而导致增值税收入大于营业收入。
2. 申报数据错误：
- 填写错误：在填写增值税申报表或企业所得税汇算清缴申报表时，可能出现数据录入错误、错行、错列等情况，导致两者数据不一致。比如将增值税申报表中的某笔收入金额填错位置，或者在汇算清缴时误将不属于本期的收入计入等。
- 数据统计口径不一致：企业在统计增值税收入和营业收入时，可能采用了不同的统计口径。例如，增值税申报中可能包含了一些免税收入、不征税收入等，而在计算营业收入时没有正确扣除这些项目，或者在统计营业收入时遗漏了某些应计入的项目，如其他业务收入等，都会造成两者之间的差异。
3. 时间性差异：
- 收入所属期间不同：如果企业存在提前或延后确认收入的情况，可能会导致增值税收入和营业收入在不同期间出现差异。例如，企业在12月底发出货物，但未及时开具发票，按照增值税规定，发货当天即产生增值税纳税义务，需在当期申报增值税收入；但会计上可能在次年1月才确认该笔收入，这就会造成当年汇算清缴时营业收入与本属期增值税收入不一致。
- 发票开具与记账时间差异：企业开具发票的时间与记账确认收入的时间可能不同步。如企业先开具发票，但尚未发货或提供服务，按照增值税规定需确认增值税收入，但会计上因不符合收入确认条件而未确认营业收入；或者企业先发货或提供服务并确认了营业收入，但未及时开具发票，导致增值税收入滞后于营业收入确认。
4. 税收政策调整与会计处理变更：
- 税收政策变化：如果在一个纳税年度内，国家出台了新的税收政策，对增值税的征收范围、税率、纳税义务发生时间等进行调整，而企业未能及时准确地按照新政策进行申报，就可能导致汇算清缴时增值税收入与营业收入出现差异。例如，某项业务原来不征收增值税，后来政策调整后需要缴纳增值税，但企业在会计处理上未及时调整，仍按原方式确认营业收入，就会出现差异。
- 会计政策变更：企业自身进行会计政策变更，如改变收入确认的方法、会计估计等，也可能引起会计上营业收入的变化，而增值税收入可能不会随之同步变动，从而产生差异。
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